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白丝 av 对于seurat作图VlnPlot小提琴图横坐标规则的修改
发布日期:2025-07-03 07:14 点击次数:96
3、付费著述汇集有打包价哦!白丝 av
笃定请干系作家:
自拍偷拍网❞前边咱们作念了一个Split小提琴图的函数(ggplot堆叠图无缝拼接(自写一个简易堆叠小提琴图函数))。有小伙伴在实行中提议了问题,等于横坐标细胞类型celltype的规则是默许摆设的,怎样按照我方的条件进行排序,权谋修改函数的表情。其实这个问题是VlnPlot作念的通用问题,和这个函数无关。咱们领先作念一个图:
library(Seurat)library(dittoSeq)library(ggplot2)library(ggpubr)makers <- c('Ltf',"Ngp",'Ccl6','Srgn','S100a9','Mmp8', 'Cstdc4', "Ccl6",'Il1b','Chn2','Stfa2l1', 'Retnlg','Olfm4','Cd177','Top2a','Stmn1')Split_Vln_stacked(mouse_data, feature = makers, split.by = 'orig.ident', split.plot = T, pt.size = 0, size = 10, cols = c("limegreen", "navy"), sig_label = 'p.signif',test = T,test_method = 't.test')
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其实问题的现实是固定因子规则,咱们之前在ggplot作图的本事屡次说起。
unique(Idents(mouse_data))# [1] PMN(3) PMN(2) PMN(1) PMN(0) PMN(5) PMN(6) PMN(4) PMN(7)# Levels: PMN(0) PMN(1) PMN(2) PMN(3) PMN(4) PMN(5) PMN(6) PMN(7)cell_levels <- c("PMN(7)","PMN(6)","PMN(5)","PMN(4)", "PMN(3)","PMN(2)","PMN(1)","PMN(0)")Idents(mouse_data) <- factor(Idents(mouse_data), levels= cell_levels)Split_Vln_stacked(mouse_data, feature = makers, split.by = 'orig.ident', split.plot = T, pt.size = 0, size = 10, cols = c("limegreen", "navy"), sig_label = 'p.signif',test = T,test_method = 't.test')
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这么就不错开合自若展示我方细胞类型规则了白丝 av。认为共享灵验的点个赞、共享下再走呗!
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